NOTE안전: 에탄올은 인화성 액체이므로 화염·가열 장치와 멀리 떨어진 곳에서 취급하고 보안경과 장갑을 착용한다. 학생이 임의로 고농도 에탄올을 다량 사용하지 않도록 지도한다. 이 실험은 DNA 존재와 추출 원리를 보여 줄 뿐, 복제 정확도 또는 유전 암호를 직접 입증하는 실험은 아니다.
표 1.4-2목차의 표현을 정확히 해석하기 “유전적 연속성은 단일 DNA 분자에 부여된다”는 문장은 개별 염색체 DNA의 연속성과 복제 가능성을 강조한 표현으로 이해하는 것
목차의 표현을 정확히 해석하기 “유전적 연속성은 단일 DNA 분자에 부여된다”는 문장은 개별 염색체 DNA의 연속성과 복제 가능성을 강조한 표현으로 이해하는 것이 적절하다. 모든 생명체의 유전정보가 단 하나의 DNA 분자에만 저장된다는 뜻은 아니다. 일부 바이러스는 DNA 대신 RNA를 유전물질로 사용한다.
표 1.4-3¹⁴N 배지로 옮긴 뒤 · 무거운 DNA(HH) · 혼성 DNA(HL) · 가벼운 DNA(LL)
¹⁴N 배지로 옮긴 뒤
무거운 DNA(HH)
혼성 DNA(HL)
가벼운 DNA(LL)
0세대
100%
0%
0%
1세대
0%
100%
0%
2세대
0%
50%
50%
3세대
0%
25%
75%
표 1.4-4구성 요소 · 주요 역할 · 생화학적 핵심
구성 요소
주요 역할
생화학적 핵심
DNA 헬리케이스
이중가닥 분리
복제분기점에서 DNA 가닥을 벌림
토포아이소머레이스
DNA 비틀림 완화
복제 전방의 꼬임과 위상 문제를 처리
단일가닥 DNA 결합 단백질
노출된 단일가닥 보호
재결합·분해 및 비정상 구조 형성 감소
프라이메이스
짧은 프라이머 합성
중합효소에 필요한 3′-OH 말단 제공
DNA 중합효소
새 가닥 합성 및 일부 교정
주형에 상보적인 dNTP를 5′→3′ 연결
프라이머 제거·치환 인자
RNA 프라이머 처리
해당 구간을 DNA로 대체
DNA 연결효소
절편 사이 틈 봉합
인산다이에스터 결합 형성
표 1.4-5더 정확히 알기 텔로머레이스가 모든 체세포에서 같은 정도로 활성화되는 것은 아니다. 또한 텔로머레이스는 전체 염색체를 복제하는 일반 DNA 중합효소가 아니라,
더 정확히 알기 텔로머레이스가 모든 체세포에서 같은 정도로 활성화되는 것은 아니다. 또한 텔로머레이스는 전체 염색체를 복제하는 일반 DNA 중합효소가 아니라, 자신의 RNA를 주형으로 DNA를 연장하는 특수한 역전사효소다.
표 1.4-6원인 또는 상황 · DNA 수준에서 일어나는 변화 · 대표적인 후속 대응
원인 또는 상황
DNA 수준에서 일어나는 변화
대표적인 후속 대응
자외선(UV)
인접 피리미딘 사이의 비정상적 공유 결합 형성
뉴클레오타이드 절제 복구
자발적 염기 탈아미노화
시토신 등이 다른 염기로 화학적 변화
염기 절제 복구
산화 스트레스
산화된 염기·가닥 손상 형성
염기 절제 복구 등
DNA 합성 오류
주형과 맞지 않는 염기쌍 형성
교정 기능·불일치 복구
이중가닥 절단
DNA 두 가닥이 함께 절단
상동 재조합 또는 비상동 말단 연결
표 1.4-7오해하지 않기 DNA 복구는 “항상 완벽한 원상 복구”가 아니다. 복구 경로 선택과 손상 상태에 따라 원래 서열이 보존되기도 하지만, 일부 복구는 염기 삽입·결
오해하지 않기 DNA 복구는 “항상 완벽한 원상 복구”가 아니다. 복구 경로 선택과 손상 상태에 따라 원래 서열이 보존되기도 하지만, 일부 복구는 염기 삽입·결실 또는 재배열을 남길 수 있다.
표 1.4-8구조 수준 · 중심 개념 · 관여하는 대표 요소
구조 수준
중심 개념
관여하는 대표 요소
1차 구조
아미노산의 공유 결합 배열
펩타이드 결합과 서열
2차 구조
주사슬의 국소 규칙 구조
수소 결합, α-나선, β-병풍
3차 구조
한 사슬의 전체적인 접힘
소수성 효과, 수소 결합, 이온 상호작용, 이황화 결합
4차 구조
여러 폴리펩타이드의 결합
소단위체 간 비공유 결합 또는 일부 공유 결합
표 1.4-9핵심 정리 유전정보는 DNA의 염기 서열에 비교적 안정하게 저장되고, 복제·교정·복구로 전달 정확도가 높아진다. 정보의 발현은 전사·RNA 가공·번역을 거쳐 단
핵심 정리 유전정보는 DNA의 염기 서열에 비교적 안정하게 저장되고, 복제·교정·복구로 전달 정확도가 높아진다. 정보의 발현은 전사·RNA 가공·번역을 거쳐 단백질의 구조와 기능으로 연결되며, 세포의 환경과 조절 상태가 실제 결과를 결정한다.
표 1.4-10관찰/예측 · 1세대 · 2세대 · 3세대
관찰/예측
1세대
2세대
3세대
반보존적 모형의 HL 비율
100%
50%
25%
반보존적 모형의 LL 비율
0%
50%
75%
원자료와 비교할 특징
중간 띠 하나
중간+가벼운 띠
가벼운 띠 비율 증가
표 1.4-11평균 오류 확률 p · 백만 염기당 기대 오류 수 · N = 2 × 10⁶일 때 기대 오류 수
평균 오류 확률 p
백만 염기당 기대 오류 수
N = 2 × 10⁶일 때 기대 오류 수
10⁻⁵
10개
20개
10⁻⁷
0.1개
0.2개
10⁻⁹
0.001개
0.002개
표 1.4-12서열 유형 · mRNA(5′→3′) · 번역 결과
서열 유형
mRNA(5′→3′)
번역 결과
기준
AUG GAA UUU UGA
Met–Glu–Phe–Stop
치환
AUG GAC UUU UGA
Met–Asp–Phe–Stop
1염기 결실
AUG AAU UUU GA…
Met–Asn–Phe–…
표 1.4-13핵심 용어 · 한 문장으로 정리
핵심 용어
한 문장으로 정리
역평행·상보성
두 DNA 가닥은 반대 방향이며 A–T, G–C 짝짓기로 주형 복제가 가능하다.
반보존적 복제
딸 DNA는 각각 기존 가닥 한 개와 새로운 가닥 한 개를 가진다.
복제 정확성
염기 선택·교정·불일치 복구가 복제 오류를 대폭 줄인다.
DNA 손상 복구
손상 유형에 맞는 BER·NER·HR·NHEJ 등의 경로가 작용한다.
전사
DNA 주형에 따라 RNA를 5′→3′로 합성한다.
번역
리보솜이 mRNA 코돈을 해독하여 폴리펩타이드를 합성한다.
단백질 접힘
서열과 환경이 함께 3차원 구조와 동적 기능을 결정한다.
표 1.4-141·2번째 염기 · 3번째 U · 3번째 C · 3번째 A · 3번째 G
1·2번째 염기
3번째 U
3번째 C
3번째 A
3번째 G
UU
UUU · Phe
UUC · Phe
UUA · Leu
UUG · Leu
UC
UCU · Ser
UCC · Ser
UCA · Ser
UCG · Ser
UA
UAU · Tyr
UAC · Tyr
UAA · Stop
UAG · Stop
UG
UGU · Cys
UGC · Cys
UGA · Stop
UGG · Trp
CU
CUU · Leu
CUC · Leu
CUA · Leu
CUG · Leu
CC
CCU · Pro
CCC · Pro
CCA · Pro
CCG · Pro
CA
CAU · His
CAC · His
CAA · Gln
CAG · Gln
CG
CGU · Arg
CGC · Arg
CGA · Arg
CGG · Arg
AU
AUU · Ile
AUC · Ile
AUA · Ile
AUG · Met
AC
ACU · Thr
ACC · Thr
ACA · Thr
ACG · Thr
AA
AAU · Asn
AAC · Asn
AAA · Lys
AAG · Lys
AG
AGU · Ser
AGC · Ser
AGA · Arg
AGG · Arg
GU
GUU · Val
GUC · Val
GUA · Val
GUG · Val
GC
GCU · Ala
GCC · Ala
GCA · Ala
GCG · Ala
GA
GAU · Asp
GAC · Asp
GAA · Glu
GAG · Glu
GG
GGU · Gly
GGC · Gly
GGA · Gly
GGG · Gly
그림 1.4-1DNA 가닥의 역평행 방향과 상보적 염기쌍을 나타낸 개념도. 결합과 원자 구조는 단순화하였다.그림 1.4-2염색체 DNA 분자의 수와 유전체의 범위가 생물과 세포에 따라 달라진다는 점을 나타낸 모식도.그림 1.4-3반보존적 복제 모형. 파랑·주황은 기존 가닥, 초록은 새로 합성된 가닥을 나타낸다.그림 1.4-4메셀슨–스탈 실험의 밀도띠를 단순화한 모식도. 띠의 위치와 너비는 정량적 원자료를 재현한 것이 아니다.그림 1.4-5복제분기점에서 선도가닥·지연가닥 합성이 동시에 진행되는 원리를 단순화한 도식이다. 프라이머의 정확한 위치와 단백질 복합체는 일부 생략하였다.그림 1.4-6DNA 복제의 정확도를 높이는 세 단계. 각 단계 옆의 수치는 효과를 이해하기 위한 가상 오류율이며 실측값이 아니다.그림 1.4-7가상의 단계별 오류율을 10⁶개 염기 복제에 적용한 기대 오류 수. 이론 계산 예시이며 실험값이 아니다.그림 1.4-8DNA 손상과 복제 오류에 대응하는 대표 수선 경로의 비교 모형.그림 1.4-9mRNA 서열의 치환과 1염기 결실이 번역 결과를 바꾸는 예. 특정 생물의 실제 유전자 서열이 아니라 교육용 예시다.그림 1.4-10DNA 복제, 전사 및 번역을 구분한 정보 흐름 도식.그림 1.4-11진핵 전구체 mRNA의 스플라이싱과 대표적 성숙 과정을 나타낸 모식도. 실제 반응의 시점과 일부 단계는 단순화하였다.그림 1.4-12표준 유전 암호 중 일부 코돈과 의미를 정리한 표 형식 도식.그림 1.4-13mRNA–tRNA–리보솜 상호작용의 교육용 개념도. tRNA 배열과 리보솜의 모양은 실제 입체 구조를 단순화한 것이다.그림 1.4-14단백질의 구조적 조직 수준을 간단히 표현한 개념도. 도식은 특정 단백질의 실측 3차원 구조가 아니다.그림 1.4-15같은 유전체를 가진 세포가 서로 다른 유전자 발현 양상과 기능을 보이는 원리를 단순화한 도식.